Кафедра ветеринарной медицины была организована в 1994 году и в то время называлась кафедрой акушерства и хирургии.
Кафедру в разные годы возглавляли Ильященко В.И. (1994 г.), Круталевич К.А. (1995-1999 гг.), Селунская Л.С. (1999-2000 гг.), Рыщанова Р.М. (2000-2002 гг.), Ильященко В.И. (2002-2006 гг.), Сулейманова К.У. (2006-2007 гг.), Байкенов М.Т. (2007-2010 гг.), Тегза А.А. (2010-2011 гг), Сулейманова К.У.(2011-2013 гг), (2013-2015 гг) Сапа В.А., с 2015 года кафедрой руководит Аубакиров М.Ж.
На кафедре были оборудованы следующие специализированные учебные аудитории: патология животных, паразитология и инвазионные болезни, эпизоотология и инфекционные болезни, ветеринарное акушерство и гинекология, ветеринарная хирургия, внутренние незаразные болезни и внутренние незаразные болезни. Неоценимый вклад в создание паразитологического музея внесли ст. преподаватель Кошкина Л.Г., доцент Сулейманова К.У., профессор Ильященко В.И.
Кафедра обеспечивает преподавание многих базовых и профилирующих дисциплин различных специальностей факультета. Подготовка специалистов ведется на государственном и русском языках.
Кафедра имеет большой опыт сотрудничества с крупнейшими вузами Казахстана, России, Ближнего и Дальнего зарубежья:
- Казахский национальный аграрный университет;
- Казахский агротехнический университет им. Сейфуллина;
- Западно-Казахстанский государственный университет;
- Уральская государственная академ ветеринарной медицины (г.Троицк);
- Латвийский сельскохозяйственный университет;
- Литовский государственный университет здравоохранения;
- Лейпцигский университет (Германия).
- Всероссиский научно-исследовательский институт ветеринарной энтомологии и арахнологий ( г. Тюмень).
Академическая мобильность.
По программе академической мобильности студенты, магистранты, преподаватели выезжают в ВУЗы ближнего и дальнего зарубежья. В ноябре 2014 года к.б.н., доцент Сулейманова. К.У., к.в.н., доцент Кулакова Л.С. посетили Уральскую государственную академию ветеринарной медицины (г. Троицк). прочитали курс лекций, проводила практические занятия для студентов ветеринарных специальностей по дисциплинам «Паразитология», «Практическая терапия». Профессор, доктор ветеринарных наук Витолиус Жилайтис (Литовский институт наук здоровья г. Каунас) в период с 16.11 по 28.11.2015 г. находился в Костанайском государственном университете им. А. Байтурсынова (Республика Казахстан), где прочитал курс лекций и лабораторно-практических занятий по следующим дисциплинам: «Ветеринарное акушерство», «Болезни органов размножения сельскохозяйственных животных», «Акушерство и биотехнология», «Искусственное осеменение с/х животных».
Ежегодно на кафедре ветеринарной медицины проводится студенческая научно-практическая конференция. По результаты практических экспериментов студенты пишут научные статьи и докладывают их на конференциях.
Главной целью кафедры ветеринарной медицины в области повышения качества образовательных услуг является осуществление учебной деятельности на уровне, обеспечивающем потребителей образования услугами, соответствующими государственным стандартам.
Реализация образовательных программ подготовки студентов, магистрантов обеспечивается научно-педагогическими кадрами, имеющими базовое образование, соответствующее профилю преподаваемых дисциплин и систематически занимающимися научной и научно-методической деятельностью.