Ветеринарлық медицина кафедрасы 1994 жылы құрылды және сол кезде Акушерлік және хирургия кафедрасы деп аталды.
Кафедраны әр жылдары Ильященко В. И. (1994 ж.), Круталевич К. А. (1995-1999 жж.), Селунская Л. С. (1999-2000 жж.), Рыщанова Р. М. (2000-2002 жж.), Ильященко В. И. (2002-2006 жж.), Сулейманова К. У. (2006-2007 жж.) басқарды, Байкенов М. Т. (2007-2010 жж.), Тегза А. А. (2010-2011 жж.), Сулейманова К. У. (2011-2013 жж.), (2013-2015 жж.) Сапа В. А., 2015 жылдан бастап кафедраны Аубакиров М. Ж. басқарады.
Кафедрада келесі мамандандырылған оқу аудиторияларымен жабдықталған: жануарлар патологиясы, паразитология және инвазиялық аурулар, эпизоотология және инфекциялық аурулар, ветеринариялық акушерлік және гинекология, ветеринариялық хирургия, ішкі жұқпалы емес аурулар және ішкі жұқпалы емес аурулар. Паразитологиялық мұражайдың құрылуына аға оқытушы Кошкина Л. Г., доцент Сулейманова К. У., профессор Ильященко В. И. баға жетпес үлес қосты.
Кафедра факультеттің әртүрлі мамандықтарының көптеген базалық және бейіндік пәндерін оқытуды қамтамасыз етеді. Мамандарды даярлау мемлекеттік және орыс тілдерінде жүргізіледі.
Кафедра Қазақстан, Ресей, жақын және алыс шетелдердің ірі жоғары оқу орындарымен ынтымақтастық жасауда үлкен тәжірибеге ие:
- Қазақ ұлттық аграрлық университеті;
- Қазақ агротехникалық университеті. Сейфуллин;
- Батыс Қазақстан мемлекеттік университеті;
- Орал мемлекеттік ветеринарлық медицина академиясы (Троицк қ .);
- Латвия ауылшаруашылық университеті;
- Литва мемлекеттік денсаулық сақтау университеті;
- Лейпциг университеті (Германия).
- Ветеринарлық энтомология және арахнология бүкілресейлік ғылыми-зерттеу институты (Тюмень).
Академиялық ұтқырлық. Академиялық ұтқырлық бағдарламасы бойынша студенттер, магистранттар, оқытушылар жақын және алыс шетелдерге барады. 2014 жылдың қараша айында б.ғ.к., доцент Сулейманова К.У. және в.ғ.к., доцент Кулакова Л.С. Урал мемлекеттік ветеринарлық медицина академиясында (Троицк қ.) болды. "Паразитология", "Практикалық терапия" пәндері бойынша ветеринарлық мамандықтар студенттеріне дәріс оқыды, практикалық сабақтар өткізді. Профессор, ветеринария ғылымдарының докторы Витолиус Жилайтис (Каунас қ. Литва денсаулық ғылымдары институты) 16.11-28.11.2015 ж. аралығында Қостанай мемлекеттік университетінде болды. А.Байтұрсынова (Қазақстан Республикасы) "Ветеринариялық акушерлік", "Ауыл шаруашылығы жануарларының көбею органдарының аурулары", "Акушерлік және биотехнология", "Ауыл шаруашылығы жануарларын жасанды ұрықтандыру" пәндері бойынша дәрістер мен зертханалық-практикалық сабақтар курсын оқыды.
Жыл сайын ветеринарлық медицина кафедрасында студенттік ғылыми-тәжірибелік конференция өткізіледі. Практикалық эксперименттердің нәтижелері бойынша студенттер ғылыми мақалалар жазады және оларды конференцияларда баяндайды.
Ветеринарлық медицина кафедрасының білім беру қызметтерінің сапасын арттыру саласындағы басты мақсаты білім беру тұтынушыларын мемлекеттік стандарттарға сәйкес келетін қызметтермен қамтамасыз ететін деңгейде оқу қызметін жүзеге асыру болып табылады.
Студенттерді, магистранттарды даярлаудың білім беру бағдарламаларын іске асыру оқытылатын пәндер бейініне сәйкес келетін базалық білімі бар және ғылыми және ғылыми-әдістемелік қызметпен жүйелі түрде айналысатын ғылыми-педагогикалық кадрлармен қамтамасыз етіледі.